MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Candidatus Hamiltonella defensa 5AT (Acyrthosiphon pisum) chromosome

Total Repeats: 9733

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012751	AGAA	2	8	469	476	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
2	NC_012751	AATTA	2	10	480	489	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_012751	AAAAG	2	10	490	499	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
4	NC_012751	ATT	2	6	556	561	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_012751	T	7	7	560	566	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_012751	GTTT	2	8	567	574	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
7	NC_012751	A	8	8	580	587	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_012751	A	6	6	607	612	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_012751	T	7	7	613	619	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_012751	A	9	9	620	628	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_012751	CTTT	2	8	630	637	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
12	NC_012751	TTTA	2	8	642	649	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_012751	AT	3	6	684	689	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_012751	ATT	2	6	698	703	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_012751	TAA	2	6	768	773	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_012751	ATT	2	6	799	804	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_012751	T	6	6	811	816	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_012751	A	6	6	1674	1679	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_012751	T	7	7	1716	1722	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_012751	TTA	2	6	1761	1766	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_012751	A	6	6	1766	1771	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_012751	AAT	2	6	3214	3219	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_012751	T	6	6	3277	3282	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_012751	TGT	2	6	3311	3316	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_012751	TGA	2	6	3321	3326	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_012751	TAT	2	6	3350	3355	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_012751	G	6	6	3384	3389	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
28	NC_012751	ATTTTG	2	12	3414	3425	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
29	NC_012751	T	7	7	3478	3484	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_012751	CTA	2	6	3578	3583	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_012751	A	6	6	3655	3660	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_012751	T	8	8	3710	3717	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_012751	TAA	2	6	3739	3744	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_012751	CCT	2	6	3758	3763	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
35	NC_012751	T	6	6	3771	3776	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_012751	CTG	2	6	3800	3805	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_012751	CTTT	2	8	3863	3870	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
38	NC_012751	T	6	6	3941	3946	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_012751	TGCT	2	8	3982	3989	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
40	NC_012751	T	7	7	4010	4016	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_012751	ATG	2	6	4017	4022	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_012751	ATA	2	6	4179	4184	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_012751	T	7	7	4346	4352	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_012751	T	6	6	4354	4359	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_012751	T	7	7	4403	4409	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_012751	T	6	6	4431	4436	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_012751	G	6	6	4440	4445	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
48	NC_012751	A	7	7	4458	4464	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_012751	TTA	2	6	4481	4486	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_012751	GCT	2	6	4513	4518	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_012751	GAAA	2	8	4528	4535	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
52	NC_012751	CCT	2	6	5020	5025	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
53	NC_012751	CAT	2	6	5054	5059	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_012751	T	7	7	5063	5069	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_012751	A	7	7	5071	5077	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_012751	TTC	2	6	5121	5126	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_012751	ATT	2	6	5170	5175	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_012751	A	8	8	5193	5200	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_012751	A	7	7	5202	5208	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_012751	A	9	9	5216	5224	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_012751	GAAA	2	8	5225	5232	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
62	NC_012751	A	8	8	5230	5237	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_012751	T	6	6	5664	5669	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_012751	ATAAA	4	20	5737	5756	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_012751	A	6	6	5778	5783	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_012751	A	6	6	5787	5792	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_012751	TAAAA	2	10	5824	5833	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_012751	T	6	6	6141	6146	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_012751	TAT	2	6	6176	6181	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_012751	ACA	2	6	6201	6206	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_012751	AAT	2	6	6234	6239	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_012751	ACTT	2	8	6263	6270	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
73	NC_012751	TAC	2	6	6276	6281	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_012751	A	8	8	6348	6355	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_012751	A	7	7	6363	6369	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_012751	TA	3	6	6379	6384	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_012751	ATT	3	9	6386	6394	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_012751	A	8	8	6404	6411	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_012751	ATTAT	2	10	6421	6430	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_012751	TA	3	6	6431	6436	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_012751	AATA	2	8	6446	6453	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_012751	T	6	6	6466	6471	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_012751	ATT	2	6	6472	6477	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_012751	AAT	2	6	6478	6483	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_012751	TTA	2	6	6500	6505	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_012751	TAA	2	6	6507	6512	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_012751	TAAAAA	2	12	6555	6566	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_012751	ATT	2	6	6567	6572	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_012751	ATA	2	6	6577	6582	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_012751	TA	3	6	6591	6596	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_012751	TATG	2	8	6602	6609	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
92	NC_012751	ATA	2	6	6624	6629	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_012751	ATTTCT	2	12	6645	6656	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
94	NC_012751	A	6	6	6680	6685	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_012751	CAA	2	6	6686	6691	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_012751	A	7	7	6759	6765	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_012751	T	7	7	6790	6796	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_012751	ATG	2	6	9503	9508	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
99	NC_012751	A	7	7	9565	9571	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_012751	TAA	2	6	9606	9611	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_012751	ATG	2	6	9628	9633	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
102	NC_012751	AC	3	6	9641	9646	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
103	NC_012751	A	6	6	9671	9676	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_012751	AT	3	6	12348	12353	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_012751	AAAGC	2	10	12356	12365	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
106	NC_012751	T	6	6	12459	12464	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_012751	T	8	8	12506	12513	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_012751	TGA	2	6	12818	12823	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
109	NC_012751	AT	3	6	12825	12830	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_012751	T	7	7	12849	12855	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_012751	TTG	2	6	12926	12931	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
112	NC_012751	T	6	6	12947	12952	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_012751	TA	3	6	13044	13049	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_012751	TCCC	2	8	13076	13083	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
115	NC_012751	TTTA	2	8	13094	13101	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_012751	TCC	2	6	13162	13167	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
117	NC_012751	T	6	6	13182	13187	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_012751	TTCG	2	8	13196	13203	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
119	NC_012751	A	6	6	13206	13211	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_012751	TGA	2	6	13247	13252	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
121	NC_012751	GAT	2	6	13255	13260	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
122	NC_012751	TTA	2	6	15044	15049	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_012751	ATTT	2	8	15061	15068	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_012751	A	7	7	15073	15079	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_012751	A	6	6	15092	15097	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_012751	CAG	2	6	15160	15165	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_012751	TGG	2	6	15197	15202	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
128	NC_012751	ACA	2	6	15204	15209	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_012751	GTT	2	6	15225	15230	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
130	NC_012751	TAA	2	6	15856	15861	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_012751	CTTA	2	8	15878	15885	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
132	NC_012751	AAAT	2	8	15891	15898	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_012751	AGGCT	2	10	15924	15933	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
134	NC_012751	T	6	6	15951	15956	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_012751	T	7	7	15968	15974	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_012751	ATG	2	6	16035	16040	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
137	NC_012751	A	7	7	16056	16062	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_012751	AAG	2	6	16073	16078	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
139	NC_012751	CAT	2	6	16102	16107	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_012751	TAT	2	6	16113	16118	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_012751	CGG	2	6	16145	16150	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
142	NC_012751	GGA	2	6	16207	16212	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
143	NC_012751	CTGGC	2	10	16242	16251	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
144	NC_012751	TAA	2	6	16341	16346	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_012751	ACG	2	6	16359	16364	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
146	NC_012751	ATT	2	6	16414	16419	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_012751	T	8	8	16509	16516	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_012751	GGA	2	6	16543	16548	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
149	NC_012751	CAG	2	6	16556	16561	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
150	NC_012751	AGA	2	6	16563	16568	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
151	NC_012751	TTTA	2	8	16574	16581	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_012751	A	6	6	16637	16642	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_012751	A	6	6	16663	16668	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
154	NC_012751	ATT	2	6	16684	16689	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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161	NC_012751	A	6	6	17106	17111	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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337	NC_012751	T	8	8	99981	99988	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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433	NC_012751	TA	3	6	122056	122061	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
434	NC_012751	ATTT	2	8	122108	122115	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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441	NC_012751	TAC	2	6	122690	122695	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
442	NC_012751	AGA	2	6	122702	122707	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
443	NC_012751	ACAA	2	8	122723	122730	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
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445	NC_012751	A	8	8	122788	122795	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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452	NC_012751	AG	3	6	123692	123697	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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483	NC_012751	A	7	7	143607	143613	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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